兩床式RTO主體結構由一個燃燒室、兩個陶瓷填料床和四個切換閥組成。該裝置中的蓄熱式陶瓷填充床換熱器可使熱能得到*限度的回收，熱回收率大于90%；處理VOC時不用或使用很少的燃料。

兩室RTO的實際操作基本原理如下：在動工時先用清新空氣代替工業廢氣，借燃燒機將儲熱室加熱到一定環境溫度。由于儲熱體具備很高的儲熱特性，所以從一個冷的RTO加熱到800~850℃,空氣還要環境溫度正常的的環境溫度遍布，一般 要經過幾天時間(目前也是有縮短到以小時計)。在正常的實際操作時，例如儲熱室A已在前一個實際操作循環系統(或稱時間跨度)中存儲了發熱量，工業廢氣首要從底部進入到儲熱室A,廢氣根據儲熱體床層被提前預熱到接近燃燒倉環境溫度，而儲熱體同時逐漸被制冷。

然后，提前預熱后的廢氣進入到頂端燃燒倉(即主反應區，混合氣體在燃燒倉中的停留的時間約為1s),在燃燒倉中有機化合物被氧化后，即作為高溫凈化處理氣進入到儲熱室B;此時，凈化處理氣將發熱量發送給儲熱體，儲熱體床層逐漸被加熱，而凈化處理氣則被制冷后排出。

當儲熱室A制冷到尚可容許的環境溫度水準時，就應切換氣體的流入，即進行第1個循環系統。切換流入后，工業廢氣進入到已被加熱過的儲熱室B,反應后的凈化處理氣則將發熱量發送給已制冷的儲熱室A,如上所述相同，進行第2個循環系統。這樣根據不斷反反復復循環系統實際操作來完成廢氣的凈化處理和發熱量的靈活運用。一個循環系統時間，即切換時間大約為30~120s(兩個切換時間就是一個全時間跨度)。假如廢氣中易燃物濃度值環境溫度自供熱實際操作的水準，那麼燃燒機只需在動工時使用，在正常的。